Основні функції Управління:

1) забезпечує формування та реалізацію державної політики у галузі авіації та використання повітряного простору України, сферах аерокосмічної зйомки, радіоелектронної розвідки та радіоелектронної боротьби, функціонування та розвитку єдиної системи авіаційної безпеки та цивільного захисту в діяльності Національної поліції, Адміністрації Держприкордонслужби, ДСНС та Національної гвардії;

2) розробляє та вживає заходи зі стратегічного прогнозування, розробки стратегій та проектів розвитку, узагальнює практику застосування законодавства та розробляє пропозиції щодо вдосконалення, розробляє проєкти законів, інших нормативно-правових та розпорядчих актів за визначеними напрямами діяльності, уносить зміни та доповнення до них, приводить їх у відповідність до законодавства України;

3) планує, організовує та забезпечує виконання заходів з функціонування та розвитку єдиної системи авіаційної безпеки та цивільного захисту в частині, що належить до компетенції МВС, Національної гвардії України та за дорученням Міністра внутрішніх справ України – у частині, що належить до компетенції авіаційних підрозділів ЦОВВ як складових сектору безпеки і оборони.